、企业运行体制不完善，趋同化倾向严重。具体表现在大型高新企业运行机制存在问题，不能很好的发挥好骨干作用;众多中小企业蜂拥而上，缺乏技术缺乏资金，持平水平重复较多，分析仪器产品线集中，但是质量和性能均与国外进口仪器有差距。

　　第二、产品结构不合理。技术含量高的产品短缺，低档产品供大于求，存在供求矛盾，无法适应严格的环境管理需要。目前，分析仪器行业的规模集中、技术水平持平、竞争无序化等问题，尤其技术性能提升后并不稳定、成套性水平稍低等问题导致中低档产品供大于求，同时高质量高性能的环保仪器又没有生产，大多依靠进口。

　　第三、研究开发能力看中但趋弱。我国企业的研发能力趋于逐步上升中，同国外企业仍有不小的差距，而且科研单位与企业之间合作的机制不够细化，使得科研成果不能快速实现产业化。简单来说在产品研发能力上有提高，但是不够完善。

　　第四、产品稳定性和性。我国产品的质量和性一直仪器仪表行业发展中的一大硬伤，也是必须解决的问题。虽然技术指标同国外同类产品比较差距不算很大，但稳定性和性不高。大地限制了我国分析产品品的使用范围，也是我国仪器仪表行业未来发展应解决的一大瓶颈，只有尽快解决这些问题，才能使国产仪器仪表具有强的竞争力。